האגף לתכנון אסטרטגי, מחקר וחדשנות בעיריית מודיעין מכבים רעות אחראי על הובלת מהלכים אסטרטגיים ועבודת מטה תכנון מדיניות עירונית בשגרה ובחירום, תוך ניתוח ואפיון סוגיות העומדות על סדר היום, עריכת סקרים עירוניים, מחקרים ואנליזות, ניתוח נתונים קיימים ותחזיות דמוגרפיות, עריכת שנתון סטטיסטי לצד גיבוש המלצות ופתרונות לטווחי זמן שונים וקיום בקרה על הביצוע.
האגף אמון על ליווי תהליכי מטה חוצי ארגון, על הקמת בנק נתונים עירוניים שמסייעים בפיתוח תשתית הידע העירוני. באמצעות כך מתאפשרת למקבלי ההחלטות בעירייה לקבל זווית נוספת לקבלת ההחלטות בהתאם לתהליכים ולמגמות תוך יצירת תהליך קביעת מדיניות מקצועי וכוללני.
האגף מסייע לייצר מנגנון להתראה מוקדמת, התמודדות עם מצבי אי-ודאות, לחצי קבוצות ואינטרסים וכן זיהוי הזדמנויות וצמתי פעולה חדשים, מתוך ראיה אינטגרטיבית. בכך האגף מסייע ליצירת סדר עדיפויות עירוני, זיהוי וניתוח המשמעויות לטווח ארוך של החלטות.
בנוסף לכך, האגף מלווה תכניות אב ופרויקטים אסטרטגיים ומסייע בהכנת תכניות עבודה שנתיות ורב שנתיות לתכנון, פיתוח וביצוע מדיניות עירונית המבוססת על איסוף וניתוח נתונים שיטתי וזיהוי צרכים עירוניים, בשיתוף עם מנהלי היחידות המקצועיות, עדכון התכניות על פי הצרכים המתעדכנים וקיום בקרה על הביצוע.
האגף לתכנון אסטרטגי, מחקר וחדשנות אחראי גם על ניהול מרכז החדשנות הדיגיטלי העירוני, משולב מערכות טכנולוגיה, מידע בזמן אמת ושירותים מתקדמים בניהול עיר חכמה. המרכז נועד להעניק פלטפורמה לניהול מעקב, שליטה ובקרה באמצעות מערכות טכנולוגיות מתקדמות וצוות עובדים לניתוח אנליטי של נתונים עירוניים בזמן אמת לצד בחינת מגמות ותכנון נדרש ברמה האסטרטגית, במטרה לנהל את המשאבים והשירותים העירוניים באופן יעיל, מהיר וחסכוני יותר.