מערכת החינוך במודיעין פתחה את שעריה בשנת 1996. מספר התלמידים היה כ- 600 והם שובצו בשני בתי ספר ממלכתיים, בית ספר אחד ממלכתי דתי ובית ספר על יסודי שמנה סך הכל 150 תלמידים.
בשנת תשפ"ה לומדים במערכת החינוך של מודיעין מכבים רעות 27,242 תלמידים.
גני הטרום חובה וגני החינוך המיוחד בעיר, כוללים 166 גני ילדים. בהם 81 גנים ממלכתיים, 38 גנים ממלכתיים דתיים ו-47 גני חינוך מיוחד, בהם ייהנו הילדים מלמידה מותאמת אישית ותומכת.
בגני החובה לומדים1,454 ב- 35 גנים ממלכתיים ו-14 גנים ממלכתיים דתיים. במקביל ישנם 70 גני קדם חובה, מהם 46 ממלכתיים ו-24 ממלכתיים דתיים. בגני הקדם חובה ילמדו 2,630 ילדים. מערך הגנים של החינוך המיוחד כולל 47 גני הילדים בהם ילמדו 413 ילדים.
בתי הספר היסודיים כוללים 32 בתי ספר בהם לומדים 10,499 תלמידים. בעיר ישנם 24 בתי ספר ממלכתיים בהם לומדים 6,882 תלמידים, ו-8 בתי ספר ממלכתיים דתיים, בהם לומדים 2,920 תלמידים.
לורם איפסום דולור סיט אמט, קונסקטורר אדיפיסינג אלית קונדימנטום קורוס בליקרה, נונסטי קלובר בריקנה סטום, לפריקך תצטריק לרטי
